MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp9

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012130	A	7	7	197	203	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
2	NC_012130	TAA	2	6	214	219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586535
3	NC_012130	ACA	2	6	223	228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586535
4	NC_012130	A	7	7	291	297	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
5	NC_012130	ACA	2	6	404	409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586535
6	NC_012130	ACT	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586535
7	NC_012130	A	6	6	473	478	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
8	NC_012130	ATAA	2	8	494	501	75 %	25 %	0 %	0 %	224586535
9	NC_012130	A	8	8	513	520	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
10	NC_012130	TAA	2	6	544	549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586535
11	NC_012130	G	7	7	592	598	0 %	0 %	100 %	0 %	224586535
12	NC_012130	TAA	2	6	607	612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586535
13	NC_012130	ATA	3	9	615	623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586535
14	NC_012130	AGA	2	6	628	633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586535
15	NC_012130	AGAA	2	8	637	644	75 %	0 %	25 %	0 %	224586535
16	NC_012130	A	6	6	643	648	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
17	NC_012130	ATA	2	6	668	673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586535
18	NC_012130	TTC	2	6	711	716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586535
19	NC_012130	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586535
20	NC_012130	TAAA	2	8	819	826	75 %	25 %	0 %	0 %	224586535
21	NC_012130	ACAAA	2	10	844	853	80 %	0 %	0 %	20 %	224586535
22	NC_012130	A	6	6	878	883	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
23	NC_012130	A	8	8	891	898	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
24	NC_012130	AAAT	2	8	921	928	75 %	25 %	0 %	0 %	224586535
25	NC_012130	A	6	6	933	938	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
26	NC_012130	TAT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586535
27	NC_012130	AATTG	2	10	1030	1039	40 %	40 %	20 %	0 %	224586535
28	NC_012130	A	6	6	1040	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
29	NC_012130	AAAC	2	8	1077	1084	75 %	0 %	0 %	25 %	224586535
30	NC_012130	AAC	2	6	1104	1109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586535
31	NC_012130	AAAAG	2	10	1111	1120	80 %	0 %	20 %	0 %	224586535
32	NC_012130	AAAAT	2	10	1170	1179	80 %	20 %	0 %	0 %	224586535
33	NC_012130	A	6	6	1187	1192	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
34	NC_012130	ATT	2	6	1206	1211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586535
35	NC_012130	ATT	2	6	1216	1221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586535
36	NC_012130	TAA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586535
37	NC_012130	A	6	6	1239	1244	100 %	0 %	0 %	0 %	224586535
38	NC_012130	TTTA	2	8	1246	1253	25 %	75 %	0 %	0 %	224586535
39	NC_012130	TA	3	6	1279	1284	50 %	50 %	0 %	0 %	224586535
40	NC_012130	AGA	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586536
41	NC_012130	GAAA	2	8	1369	1376	75 %	0 %	25 %	0 %	224586536
42	NC_012130	A	10	10	1374	1383	100 %	0 %	0 %	0 %	224586536
43	NC_012130	AGT	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586536
44	NC_012130	A	6	6	1442	1447	100 %	0 %	0 %	0 %	224586536
45	NC_012130	AAG	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586536
46	NC_012130	T	6	6	1545	1550	0 %	100 %	0 %	0 %	224586536
47	NC_012130	A	6	6	1559	1564	100 %	0 %	0 %	0 %	224586536
48	NC_012130	A	6	6	1570	1575	100 %	0 %	0 %	0 %	224586536
49	NC_012130	A	6	6	1607	1612	100 %	0 %	0 %	0 %	224586536
50	NC_012130	T	6	6	1668	1673	0 %	100 %	0 %	0 %	224586536
51	NC_012130	TA	3	6	1676	1681	50 %	50 %	0 %	0 %	224586536
52	NC_012130	A	7	7	1702	1708	100 %	0 %	0 %	0 %	224586536
53	NC_012130	AGAT	2	8	1713	1720	50 %	25 %	25 %	0 %	224586536
54	NC_012130	TAA	2	6	1729	1734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586536
55	NC_012130	TTG	2	6	1740	1745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586536
56	NC_012130	A	6	6	1790	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	224586536
57	NC_012130	A	6	6	1831	1836	100 %	0 %	0 %	0 %	224586536
58	NC_012130	ATA	2	6	1843	1848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586536
59	NC_012130	AAT	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586539
60	NC_012130	TAA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586539
61	NC_012130	A	7	7	1981	1987	100 %	0 %	0 %	0 %	224586539
62	NC_012130	AAG	2	6	2014	2019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586539
63	NC_012130	AT	4	8	2021	2028	50 %	50 %	0 %	0 %	224586539
64	NC_012130	ATT	2	6	2045	2050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586539
65	NC_012130	TAA	2	6	2051	2056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586539
66	NC_012130	ATC	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586539
67	NC_012130	ATA	2	6	2078	2083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586539
68	NC_012130	A	6	6	2160	2165	100 %	0 %	0 %	0 %	224586539
69	NC_012130	TA	3	6	2197	2202	50 %	50 %	0 %	0 %	224586539
70	NC_012130	TTA	2	6	2252	2257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586539
71	NC_012130	ACT	2	6	2313	2318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586539
72	NC_012130	T	6	6	2323	2328	0 %	100 %	0 %	0 %	224586539
73	NC_012130	ATAA	2	8	2329	2336	75 %	25 %	0 %	0 %	224586539
74	NC_012130	CAA	2	6	2369	2374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586539
75	NC_012130	A	8	8	2380	2387	100 %	0 %	0 %	0 %	224586539
76	NC_012130	A	7	7	2420	2426	100 %	0 %	0 %	0 %	224586539
77	NC_012130	AGA	2	6	2470	2475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586539
78	NC_012130	ATG	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586539
79	NC_012130	TAGA	2	8	2501	2508	50 %	25 %	25 %	0 %	224586539
80	NC_012130	TA	3	6	2512	2517	50 %	50 %	0 %	0 %	224586539
81	NC_012130	AAT	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586544
82	NC_012130	GAA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586544
83	NC_012130	A	9	9	2702	2710	100 %	0 %	0 %	0 %	224586544
84	NC_012130	ATA	2	6	2716	2721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586544
85	NC_012130	AAG	3	9	2722	2730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586544
86	NC_012130	ACA	2	6	2777	2782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586544
87	NC_012130	GAAA	2	8	2819	2826	75 %	0 %	25 %	0 %	224586544
88	NC_012130	AGA	2	6	2957	2962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586544
89	NC_012130	TTA	2	6	2970	2975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586544
90	NC_012130	A	6	6	3025	3030	100 %	0 %	0 %	0 %	224586544
91	NC_012130	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	224586544
92	NC_012130	TAA	2	6	3052	3057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586544
93	NC_012130	A	8	8	3105	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	224586544
94	NC_012130	ATG	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586544
95	NC_012130	GAA	2	6	3182	3187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586544
96	NC_012130	AAT	2	6	3497	3502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586540
97	NC_012130	TAG	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586540
98	NC_012130	TCA	2	6	3860	3865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586540
99	NC_012130	AAG	2	6	3910	3915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586540
100	NC_012130	ACA	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586540
101	NC_012130	CTA	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586540
102	NC_012130	A	8	8	4011	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	224586540
103	NC_012130	AAATCA	2	12	4024	4035	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224586540
104	NC_012130	A	6	6	4039	4044	100 %	0 %	0 %	0 %	224586540
105	NC_012130	TAA	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586540
106	NC_012130	TTA	2	6	4075	4080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586540
107	NC_012130	A	6	6	4114	4119	100 %	0 %	0 %	0 %	224586540
108	NC_012130	A	6	6	4140	4145	100 %	0 %	0 %	0 %	224586540
109	NC_012130	TAA	2	6	4161	4166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586540
110	NC_012130	ATG	3	9	4185	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586540
111	NC_012130	ATA	2	6	4200	4205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586540
112	NC_012130	ATT	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586540
113	NC_012130	TAA	2	6	4279	4284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586540
114	NC_012130	GAT	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586540
115	NC_012130	T	7	7	4358	4364	0 %	100 %	0 %	0 %	224586540
116	NC_012130	AGA	2	6	4375	4380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586540
117	NC_012130	TA	3	6	4394	4399	50 %	50 %	0 %	0 %	224586540
118	NC_012130	TAA	2	6	4409	4414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586540
119	NC_012130	CTAT	2	8	4514	4521	25 %	50 %	0 %	25 %	224586542
120	NC_012130	T	6	6	4521	4526	0 %	100 %	0 %	0 %	224586542
121	NC_012130	TATC	2	8	4547	4554	25 %	50 %	0 %	25 %	224586542
122	NC_012130	AAATT	2	10	4559	4568	60 %	40 %	0 %	0 %	224586542
123	NC_012130	T	7	7	4574	4580	0 %	100 %	0 %	0 %	224586542
124	NC_012130	T	7	7	4588	4594	0 %	100 %	0 %	0 %	224586542
125	NC_012130	T	10	10	4725	4734	0 %	100 %	0 %	0 %	224586542
126	NC_012130	A	6	6	4784	4789	100 %	0 %	0 %	0 %	224586542
127	NC_012130	T	6	6	4795	4800	0 %	100 %	0 %	0 %	224586542
128	NC_012130	TA	3	6	4830	4835	50 %	50 %	0 %	0 %	224586542
129	NC_012130	AAT	2	6	4837	4842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586542
130	NC_012130	TAC	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586533
131	NC_012130	GTG	2	6	5246	5251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586533
132	NC_012130	T	6	6	5344	5349	0 %	100 %	0 %	0 %	224586533
133	NC_012130	TAT	2	6	5406	5411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586533
134	NC_012130	T	7	7	5461	5467	0 %	100 %	0 %	0 %	224586533
135	NC_012130	ATT	2	6	5479	5484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586533
136	NC_012130	T	8	8	5507	5514	0 %	100 %	0 %	0 %	224586533
137	NC_012130	AAC	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586533
138	NC_012130	TAG	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586541
139	NC_012130	T	6	6	5660	5665	0 %	100 %	0 %	0 %	224586541
140	NC_012130	AAG	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586541
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203	NC_012130	CTTA	2	8	9130	9137	25 %	50 %	0 %	25 %	224586538
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.